Protein–RNA interactions for Protein: Q61666

Hira, Protein HIRA, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HiraQ61666 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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HiraQ61666 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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HiraQ61666 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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HiraQ61666 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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HiraQ61666 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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HiraQ61666 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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HiraQ61666 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HiraQ61666 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms