Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1aQ61495 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms