Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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MslnQ61468 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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MslnQ61468 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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MslnQ61468 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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MslnQ61468 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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MslnQ61468 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MslnQ61468 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms