Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Abcd2Q61285 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcd2Q61285 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms