Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d1Q60949 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms