Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf4Q60793 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms