Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HnrnpdQ60668 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms