Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brip1Q5SXJ3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms