Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms