Protein–RNA interactions for Protein: Q5JCT0

Gcnt3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt3Q5JCT0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcnt3Q5JCT0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcnt3Q5JCT0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcnt3Q5JCT0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcnt3Q5JCT0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcnt3Q5JCT0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcnt3Q5JCT0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms