Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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R3hdm4Q4VBF2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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