Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox3aQ4TU90 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms