Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms