Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk4Q3V129 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms