Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc110Q3V125 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms