Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Dnah12Q3V0Q1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Dnah12Q3V0Q1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Dnah12Q3V0Q1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms