Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms