Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms