Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms