Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnga4Q3UW12 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms