Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms