Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms