Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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