Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec31aQ3UPL0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms