Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog7Q3UM29 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms