Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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