Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx27Q3UHD6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms