Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms