Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms