Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms