Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc174Q3U155 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms