Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem35bQ3U0Y2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms