Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy4Q3TYX8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms