Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hhla1Q3TYV2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms