Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms