Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Shroom4Q1W617 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Shroom4Q1W617 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Shroom4Q1W617 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Shroom4Q1W617 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Shroom4Q1W617 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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Shroom4Q1W617 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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Shroom4Q1W617 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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