Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cpne9Q1RLL3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cpne9Q1RLL3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne9Q1RLL3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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