Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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