Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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