Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms