Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms