Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms