Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cib3Q0P523 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms