Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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Ttc21bQ0HA38 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ttc21bQ0HA38 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ttc21bQ0HA38 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ttc21bQ0HA38 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Ttc21bQ0HA38 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttc21bQ0HA38 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms