Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgm3Q08189 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgm3Q08189 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgm3Q08189 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgm3Q08189 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgm3Q08189 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms