Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MestQ07646 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MestQ07646 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms