Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col17a1Q07563 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms