Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms