Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms