Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Caprin2Q05A80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms